CiberEMAT està plantejat per a ser utilitzat com a complement del Llibre de l'alumne, una vegada a la setmana. L'itinerari d'activitats per a cada curs consta de 42 sessions. Quan parlem de sessió, ens referim a una activitat setmanal que dura uns 10 minuts.
Cada sessió consta de set activitats en les quals els alumnes continuen practicant les habilitats matemàtiques treballades a l'aula, relacionades amb els blocs temàtics del programa EMAT: Numeració, Resolució de problemes, Raonament lògic, Percepció visual, Orientació espacial, Geometria i Mesura.
També existeix la possibilitat de triar i practicar activitats, problemes de càlcul, vídeos i cançons lliurement en el menú d'activitats o quan així ho indiqui l'activitat del dia o, fins i tot, en moments que no siguin la classe de matemàtiques, de manera lúdica. Cada activitat pot tenir una durada variable.